Для изготовления нанотрубки и визуализации НМ вам понадобятся PyMOL и два скрипта для него: Генератор НТ: http://erg.biophys.msu.ru/~piton/ntgen.py Визуализатор нормальных мод: http://erg.biophys.msu.ru/~piton/nmgen.py Скрипты нужно скачать и запустить из PyMOL. Например: $ wget http://erg.biophys.msu.ru/~piton/ntgen.py $ pymol PyMOL> run ./ntgen.py На наших машинах PyMOL и соответствующие скрипты у студентов установлены. Создание нанотрубки: PyMOL> ntgen nanotube, N, M, L, […]
Метки
Последние записи
- MD Practice #1 — making toy force field
- Теория молекулярно-динамических расчетов (видео)
- Малый практикум по квантовой химии
- Compiling CP2K
- OPLS-AA patch for different types of molecules
- Reaction-diffusion systems in 2D space with python
- Constructing discrete Laplacian via sparse matrix
- All-atom automatic OPLS-AA topology generator
- Scanning PES ab initio and in MM
- Quantum chemistry information page
Комментарии
- SergGep in Пример построения …
- web page in Теория молекулярно…
- sergey in All-atom automatic OPLS-AA topology…
- 당진 스크… in Теория молекулярно…
- user in All-atom automatic OPLS-AA topology…
- best menu price… in Теория молекулярно…
- Anggon Barua in All-atom automatic OPLS-AA topology…
- colon cancer cu… in Теория молекулярно…
- game outsourcin… in Теория молекулярно…
- jvaldiviezo in All-atom automatic OPLS-AA topology…